在游戏开始时，教授会给予玩家三只口袋妖怪中的一只：小火龙、杰尼龟和妙蛙种子。这三只口袋妖怪分别代表着火、水和草这三种不同的属性类型，而这一选择将对玩家后续的游戏体验产生深远的影响。它们各自演化的形态，以及它们在对战中的表现，都是选手需要考虑的重要因素。
小火龙，最终能够演化成威力强大的喷火龙，是许多玩家的首选。小火龙及其演化形态在攻击力上有着很高的表现，同时喷火龙的飞行和火属性也让它在对战中有着良好的多样性。初期的小火龙在面对石系和水系道馆时可能会遇到一些挑战。
作为水属性的代表，杰尼龟和它的演化形态，水箭龟，提供了非常均衡的属性。在防御力和攻击力方面都相当可靠。杰尼龟在游戏的早期相对容易养育，尤其是在对抗石系和火系对手时更有优势，但在面对草系和电系敌人时需要格外小心。
妙蛙种子及其演化系列绝对是策略型玩家的最爱。草/毒双属性赋予了它独特的战斗策略，尤其是在对抗水系、岩石系和地面系的口袋妖怪时。妙蛙种子在面对火系、飞行系和超能力系口袋妖怪时可能会吃力。
火属性优势在于高攻击力，劣势是在早期可能会遇到一些难缠的对手，比如岩石系和水系的道馆。
水属性的优势是均衡的攻防以及在对战中的适应性强，但需要注意电系和草系的口袋妖怪。
草属性的优势在于特殊的战斗方式和对某些类型的强大克制，但在面对火、飞行和冰属性时要小心。
不论选择哪一只起始口袋妖怪，玩家都需要注意其养成和战术的匹配。训练和升级，以及合理利用属性相克，是游戏成功的关键。调整战队结构以应对不同对手也同样重要。如果选择了小火龙，那么在早期可能需要捕捉一些水属性或草属性的口袋妖怪来补充战队。
口袋妖怪火红的初期宠物选择不仅关系到玩家早期的游戏体验，更在一定程度上影响整个游戏的进程。不论选择小火龙、杰尼龟还是妙蛙种子，重要的是了解每个口袋妖怪的属性和优势，以及如何围绕它们制定策略和构建战队。随着游戏的深入，玩家还将遇到更多种类的口袋妖怪，这时，初期的选择将成为众多因素中的一部分。不论选择哪一只起始口袋妖怪，重要的是享受这场充满挑战与乐趣的冒险之旅。
